震撼！华大LUSH基因序列比对加速工具集再次突破计算极限！

 2017年5月 ，19岁的拥有世界 围棋第有有个人柯洁九段在和AlphaGo的围棋终极人机大战以0:3完败  ，本来是人类自身顶尖高手与这台机器彼此之彼此之间然后二次较量 ，同年10月 《Nature》杂志发表了高达它所有内容此前版本的AlphaGo Zero。不过胜利向拥有世界 展示了逐步建立管理系统腾讯体育学一次一次成功复杂任务后的本来性 ，而其背后所代表人是为运算能力强大大 ，是计算机科学的分支技术领域--高性能计算（High Performance Computing） ，本来际应用以及 它它成国家中综合整体实力的体现  ，更给多数人 的日常这样带来震撼来震撼了能发生变化 ，目前来看该技术方面已在航空航天、核试验模拟、天气预报、生命之科学、高新制造（汽车、微电子）等技术领域胜利了广泛应用。

以生命之科学技术领域举例 ，日渐生命之遗传密码（基因组）的日渐破解  ，人的生老病死不过复杂做做的事就能用数字化的利用它确定呈现  ，以期一次一次成功疾病的精准数据分析、诊断和常规治疗 ，让多数人 远离传感染疾病、防控出生缺陷、肿瘤和心脑血管疾病  ，全面质的提升 人均预期寿命  ，并大幅度全面质的提升 社会所卫生总负担。

近二十年来 ，有有个人全基因组测序的成本以“超摩尔定律”的速度很快下降  ，而高性能计算在测序其他数据数据分析其他方向的应用也发生过了翻天覆地的能发生变化。目前来看拥有世界 主流的基因组测序其他数据数据分析工具是Broad Institute开发的免费开源工具集GATK（Genome Analysis Toolkit）  ，该项生命之科学技术领域公认的最佳工作后流程一次一次成功有有有个人全基因组（Whole Genome Sequencing  ，WGS）30X其他数据数据分析就能1800分钟。深耕于基因组学20多年的华大基因在基因组高性能计算技术领域已胜利突破性进展  ，于近日一次成功一次一次成功6分钟一次一次成功30X WGS全流程的数据分析任务后 ，相较于GATK两个标准计算时长提速300倍。

实际情况NIH公布的最新资料  ，日渐测序技术方面的发展其他方向  ，测序成本以超摩尔定律下

https://www.genome.gov/about-genomics/fact-sheets/DNA-Sequencing-Costs-Data

6分钟一次一次成功30X WGS任务后是由华大基因自主研发的LUSH工具集一次一次成功的  ，打破了软件工具工具在2020年1月创造的15分钟极限速度很快。多达的黑科技便是采用两个标准了新的发展的发展底层架构采用两个标准细节  ，提供全面了技术基础中央后续处理器和图形后续处理器相运用展开基因其他数据数据分析的高性能速度很快方案 ，在全面质的提升 集群计算资源消耗、全面质的提升 检出速度很快的以及 ，一次一次成功了全程自动化、各类信息化  ，有记录可回溯  ，就能更优秀地用于精准医学的应用场景。

LUSH工具集速度很快的新的发展底层架构逻辑

LUSH工具集提供全面不过种追求 “CPU+GPU”的高并行软硬件各种问题解决方案  ，技术基础经典流程中则 软件工具模块BWA、SAMTOOLS和GATK  ，利用它GPU的通用运算技术方面 ，展开计算引擎和速度很快引擎的新的发展架构采用两个标准细节  ，一次一次成功算法优化和并行化后续处理  ，并运用华大自主研发的超高通量测序仪  ，一次一次成功碱基其他数据流的超高速数据分析  ，然后已胜利准确的数据分析然后。

LUSH工具集速度很快流程示意图

便是本来生命之数字化进程就能严谨的科学超越精神  ，而其应用场景二是体算是精准医疗、健康管理等与人类自身健康密不可分息息有关的技术领域  ，本来不同人于或者高性能计算技术领域 ，基因组其他数据数据分析对精度有极高的其要求。而本来高性能和准确性其实不可不过兼得  ，其他数据之内、分布和浮点精度、峰值性能和内存也带来震撼震撼影响算法的再选择  ，更是涉及到之一最优解和近似解的算法本来大相径庭。LUSH工具集便是展开在经典流程算法的技术基础上利用它了其新的发展采用两个标准细节的底层架构逐步减轻 了中间位置然后的读写  ，并利用它CPU一次一次成功基因数据分析任务后的智能分发  ，利用它GPU数千计算核心一次一次成功百万任务后的极速并行后续处理  ，以及 各种问题解决了经典流程计算密度较高、频繁地存储器访问等各种问题解决  ，经多测试其两个标准品的准确性然后与经典流程一致  ，高达99.86% ，除了其就能在计算然后的准确性与极速性上得以平衡。

更优越的性能、更低的成本和更高效的检出是所有内容高性能计算应用技术领域的研发追求具体目标。对速度很快组件的不断 研发腾讯体育对速度很快无止境的追求  ，正如两两部手机芯片行业多的发展其他方向是日渐移动端实际需求的旺盛  ，技术方面才得以日渐地迭代和进步。从基因组学技术基础深入研究到临床深入研究及应用  ，一次一次成功测序工具的自主可控的以及 方能能一次一次成功数学形式上用自主研发 ，而不本来追求芯片的底层下潜开发。对后者是无止境的追求 ，而方能前者在不过可控须要一次一次成功从跟随模仿到方能超越的本来  ，从核心算法的研发上助力中国目前目前精准医疗自主可控的发展其他方向进程。